Analysis of pair 4tsyD_3zwgN

4tsyD vs 3zwgN

Figure 1: Two structures (Fold1 & Fold2)

Figure 2: Two structures aligned

Missing: Fold1 vs best AF2
Missing: Fold2 vs best AF2
Missing: Fold1 vs best AF3
Missing: Fold2 vs best AF3
Missing: Fold1 vs best ESM2
Missing: Fold2 vs best ESM2
Missing: Fold1 vs best ESM3
Missing: Fold2 vs best ESM3
[missing] 4tsyD vs. 3zwgN (unaligned) — interactive
[missing] 4tsyD vs. 3zwgN (aligned) — interactive

Figure 3: Deep-MSA contact map panel

Figure 4: Best clusters contact map panel

Figure 5: All clusters contact-map mosaic (small multiples).

Per-cluster contact maps

Figure 6: Aligned per-residue ΔΔG (seq alignment overlay).

Figure 7: Phylogenetic tree with per-cluster heatmap.

Cluster metrics table

clusternneffAF2_TM1AF2_TM2AF3_TM1AF3_TM2RE-MSAT-COMRE-MSAT1RE-MSAT2ESM_SEQIDSESM_TM1_LISTESM_TM2_LIST
Deep--0.850.980.850.990.430.420.38---
000--0.850.990.850.990.420.410.37001; 001; 009; 009; 007; 007; 002; 002; 003; 0030.85; 0.85; 0.80; 0.80; 0.77; 0.77; 0.75; 0.74; 0.73; 0.730.98; 0.98; 0.85; 0.85; 0.84; 0.84; 0.82; 0.82; 0.71; 0.71

Aligned per-residue ΔΔG

aln_posaa1aa2E1E2dEdiff
1-A-3.78-
2-D-9.89-
3VV2.826.72-3.9
4AA2.294.25-1.97
5GG2.792.010.79
6AA-0.320.08-0.4
7VV-0.32-1.981.66
8II1.33-2.343.67
9DD3.15-1.254.4
10GG-0.23-0.08-0.14
11AA-0.551.97-2.52
12GG1.28-0.151.43
13LL0.07-3.733.79
14GG-0.51-0.15-0.36
15FF2.529.37-26.86
16DD-1.075.02-6.09
17VV-1.230.56-1.79
18LL-0.71-3.913.19
19KK2.911.911.01
20TT-0.755.96-6.7
21VV0.351.42-1.07
22LL-2.27-1.64-0.63
23EE1.17-0.51.67
24AA-0.31-0.12-0.19
25LL4.94.230.66
26GG0.36-2.092.45
27NN-0.015.12-5.13
28VV-0.812.74-3.55
29KK2.368.37-6.01
30RR-4.040.38-4.42
31KK7.67-3.7111.38
32II2.12-4.987.1
33AA-0.62-3.342.72
34VV-2.79-1.93-0.86
35GG1.710.121.59
36II-2.67-1.4-1.28
37DD2.032.32-0.29
38NN-1.06-1.370.31
39EE3.413.62-0.22
40SS-2.83-2.08-0.75
41GG-0.99-1.070.07
42KK5.541.563.98
43TT-0.44-1.931.5
44WW-2.91-2.71-0.21
45TT-0.75-0.13-0.62
46AA-1.59-1.56-0.04
47MM-0.261.8-2.06
48NN1.382.42-1.04
49TT-1.61-1.980.37
50YY-2.03-0.93-1.1
51FF-1.2-1.810.61
52RR4.317.32-3.02
53SS1.04-1.462.5
54GG-1.47-3.171.7
55TT0.21.89-1.69
56SS2.491.21.29
57DD0.123.19-3.07
58II-0.510.64-1.14
59VV1.593.93-2.34
60LL2.4810.93-8.46
61PP8.212.0-3.81
62HH0.450.410.04
63KK0.82.23-1.43
64VV1.22-3.444.66
65AA2.230.321.91
66HH0.531.42-0.89
67GG-1.35-3.291.95
68KK1.975.4-3.43
69AA0.2-2.953.15
70LL7.881.995.89
71LL1.430.660.78
72YY-1.01-0.35-0.66
73NN-0.430.34-0.76
74GG-2.22-1.26-0.96
75QQ2.780.112.68
76KK0.350.97-0.62
77NN-0.711.92-2.63
78RR-0.424.29-4.7
79GG-0.071.78-1.85
80PP-2.592.13-4.72
81VV2.6112.33-9.71
82AA-0.460.84-1.3
83TT0.771.88-1.11
84GG-2.46-1.4-1.06
85VV-1.04-0.81-0.23
86VV-2.42-1.06-1.37
87GG-3.03-2.19-0.84
88VV-5.53-4.04-1.49
89II-4.1-3.97-0.13
90AA-3.44-1.97-1.46
91YY-4.02-3.78-0.24
92SS6.948.06-1.12
93MM-1.030.77-1.8
94SS4.220.024.2
95DD0.951.17-0.22
96GG-1.94-2.010.08
97NN-5.33-3.36-1.97
98TT-2.43-2.24-0.19
99LL-5.25-3.75-1.5
100AA-2.97-2.39-0.58
101VV-2.97-4.271.3
102LL-3.263.5-6.76
103FF-1.78-1.5-0.29
104SS-2.5-1.0-1.51
105VV3.092.330.76
106PP-0.09-0.290.2
107YY-1.153.07-4.22
108DD-0.94-1.020.08
109YY1.855.96-4.11
110NN1.841.770.07
111WW0.53.49-2.99
112YY-0.562.92-3.48
113SS1.070.950.12
114NN-3.73-2.13-1.6
115WW-3.37-2.49-0.87
116WW-6.22-5.57-0.65
117NN-3.024.37-7.39
118VV-1.79-1.72-0.07
119RR5.0610.76-5.7
120VV-1.51-3.552.04
121YY-4.7-2.31-2.39
122KK2.313.04-10.73
123GG-1.76-0.97-0.78
124QQ10.131.878.26
125KK1.232.5-1.27
126RR1.420.80.63
127AA-4.54-4.45-0.08
128DD1.53-0.82.34
129QQ-0.554.09-4.64
130RR6.2810.06-3.78
131MM-1.92-2.250.33
132YY-0.27-2.852.57
133EE1.05-2.733.78
134EE-2.510.05-2.56
135LL-5.52-5.720.19
136YY-2.39-0.88-1.51
137YY0.262.45-2.19
138HH0.035.17-5.14
139RR4.467.13-2.68
140SS6.153.662.49
141PP1.71-2.934.64
142FF-2.53-2.03-0.5
143RR8.571.187.39
144GG1.111.9-0.79
145DD2.094.43-2.35
146NN-3.54-1.08-2.46
147GG0.661.24-0.59
148WW-4.91-4.69-0.22
149HH-1.44-0.72-0.72
150SS4.51.13.41
151RR4.116.84-2.73
152GG1.681.280.4
153LL-3.11-2.65-0.46
154GG-0.22-0.19-0.04
155YY1.610.810.8
156GG-0.75-2.031.28
157LL-3.2-5.212.01
158KK6.130.655.48
159SS1.370.031.34
160RR3.074.5-1.44
161GG-0.64-0.980.35
162FF-3.28-3.390.11
163MM-2.8-1.94-0.86
164NN1.04-1.622.66
165SS-0.091.26-1.36
166SS2.522.77-0.24
167GG-0.593.58-4.17
168HH3.213.88-0.68
169AA-0.46-2.482.02
170II8.24-0.128.36
171LL-4.43-5.951.52
172EE-2.47-3.591.11
173II-5.09-4.84-0.25
174HH-1.8-1.61-0.19
175VV-4.56-4.19-0.37
176TT-2.17-1.06-1.11
177KK0.527.74-7.22
178AA0.48-0.631.11
179X--1.78--
180X--3.18--
181X--2.66--
182X--3.13--
183X--1.5--
184X-2.14--
185X--1.57--
186X-2.05--
187X-2.2--
188-A-2.03-
189-D-10.74-
190VV2.6328.57-25.94
191AA2.33.07-0.78
192GG2.475.38-2.91
193AA-0.26-0.730.46
194VV-0.33-2.131.8
195II-0.54-2.752.21
196DD3.24-1.634.87
197GG-0.360.15-0.51
198AA-1.472.0-3.46
199GG0.92-0.081.0
200LL0.25-3.774.01
201GG-0.55-0.36-0.19
202FF-0.359.19-9.54
203DD-0.424.6-5.02
204VV-1.30.3-1.61
205LL-0.71-4.313.6
206KK3.021.851.16
207TT-0.525.34-5.86
208VV0.321.84-1.52
209LL-2.33-1.77-0.55
210EE0.99-0.591.58
211AA-0.17-0.08-0.08
212LL5.023.871.15
213GG0.4-2.082.48
214NN-0.024.87-4.89
215VV-1.342.36-3.7
216KK2.298.07-5.78
217RR-3.22-0.05-3.17
218KK7.45-3.3710.82
219II2.04-4.226.26
220AA-0.66-3.452.79
221VV-2.67-2.42-0.25
222GG1.680.461.22
223II-2.83-1.53-1.3
224DD1.771.91-0.13
225NN-1.1-1.220.11
226EE3.433.20.23
227SS-2.68-2.41-0.28
228GG-1.26-1.0-0.26
229KK6.80.815.99
230TT-0.44-1.81.36
231WW-2.79-2.41-0.38
232TT-1.13-0.31-0.82
233AA-2.2-2.580.38
234MM-1.730.46-2.19
235NN0.441.98-1.54
236TT-1.92-1.55-0.37
237YY-2.09-1.19-0.9
238FF-2.39-2.28-0.11
239RR4.137.09-2.96
240SS0.78-1.332.11
241GG-1.89-3.071.19
242TT0.252.4-2.15
243SS1.760.681.07
244DD0.813.98-3.17
245II-1.2-0.09-1.11
246VV1.290.920.37
247LL0.2810.56-10.29
248PP8.3212.88-4.56
249HH-0.414.06-4.47
250KK0.382.41-2.03
251VV1.45-3.374.82
252AA2.240.271.97
253HH0.61.7-1.1
254GG-1.47-3.321.85
255KK2.046.4-4.36
256AA0.09-2.672.75
257LL8.11.936.17
258LL1.52-0.11.62
259YY-0.9-0.18-0.72
260NN-0.310.29-0.6
261GG-2.32-1.23-1.09
262QQ2.69-0.363.05
263KK0.311.01-0.71
264NN-1.422.07-3.48
265RR2.174.78-2.61
266GG-0.091.51-1.6
267PP-2.151.36-3.51
268VV1.9422.16-20.22
269AA-0.540.51-1.05
270TT0.742.25-1.52
271GG-3.44-1.16-2.28
272VV-1.0-0.77-0.24
273VV-1.15-0.89-0.26
274GG-3.14-2.32-0.82
275VV-5.48-4.62-0.86
276II-4.02-4.180.16
277AA-3.34-1.7-1.64
278YY-3.79-3.78-0.01
279SS6.848.32-1.47
280MM-0.960.14-1.09
281SS2.00.351.64
282DD1.141.74-0.61
283GG-1.87-2.160.29
284NN-5.61-3.39-2.23
285TT-2.21-1.66-0.55
286LL-5.21-2.48-2.73
287AA-3.02-2.36-0.66
288VV-2.81-4.551.74
289LL-2.832.84-5.66
290FF-2.21-1.75-0.46
291SS-2.59-0.54-2.05
292VV0.981.4-0.42
293PP-2.18-0.46-1.73
294YY-1.523.19-4.71
295DD-0.77-0.7-0.07
296YY2.175.93-3.76
297NN1.212.09-0.88
298WW-0.13.53-3.63
299YY-0.32.83-3.14
300SS1.811.130.68
301NN-4.14-2.51-1.63
302WW-4.11-2.61-1.5
303WW-6.1-5.63-0.48
304NN-2.863.77-6.62
305VV-1.83-2.070.23
306RR5.2410.33-5.09
307VV-1.45-3.221.77
308YY-4.56-2.24-2.32
309KK2.817.87-5.06
310GG-1.66-1.11-0.55
311QQ9.91.638.27
312KK1.082.08-1.0
313RR1.10.130.97
314AA-4.46-4.3-0.16
315DD1.46-1.352.81
316QQ-0.343.75-4.09
317RR6.4710.87-4.4
318MM-1.95-3.241.29
319YY0.17-2.362.53
320EE1.18-2.583.77
321EE-2.470.25-2.73
322LL-5.44-5.940.49
323YY-1.7-0.95-0.75
324YY-2.722.52-5.24
325HH0.154.94-4.79
326RR4.786.94-2.17
327SS4.123.950.16
328PP-0.25-3.122.88
329FF-2.44-1.95-0.49
330RR8.511.247.27
331GG1.051.94-0.9
332DD2.334.3-1.97
333NN-3.79-0.64-3.16
334GG0.650.78-0.13
335WW-4.15-4.90.75
336HH-2.33-0.71-1.62
337SS4.431.313.12
338RR4.176.95-2.78
339GG1.961.490.47
340LL-2.74-2.22-0.51
341GG-0.370.21-0.57
342YY1.260.880.39
343GG-0.81-1.760.95
344LL-3.1-5.272.17
345KK5.130.684.45
346SS1.63-0.161.79
347RR3.633.620.02
348GG-0.53-1.040.5
349FF-3.46-3.05-0.41
350MM-2.78-2.63-0.15
351NN0.64-1.432.07
352SS0.141.54-1.4
353SS2.333.28-0.95
354GG-0.573.41-3.97
355HH3.443.75-0.31
356AA-0.46-2.011.55
357II7.95-1.018.96
358LL-4.32-6.031.71
359EE-2.34-3.71.36
360II-5.15-5.430.28
361HH-2.03-1.89-0.14
362VV-4.52-4.34-0.18
363TT-2.15-1.34-0.81
364KK1.717.91-6.2
365AA0.23-0.380.61
366X--4.63--
367X--1.17--
368X--4.17--
369X--2.56--
370X--6.28--
371X--0.7--
372X--0.67--
373X--0.84--
374-A-2.59-
375-D-10.08-
376VV2.6612.25-9.6
377AA2.353.74-1.39
378GG2.441.151.29
379AA-0.24-0.480.25
380VV-0.34-2.081.74
381II-0.58-1.961.38
382DD3.16-1.44.57
383GG-0.250.14-0.39
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