Analysis of pair 3mkoA_5ineA

3mkoA vs 5ineA

Figure 1: Two structures (Fold1 & Fold2)

Figure 2: Two structures aligned

Missing: Fold1 vs best AF2
Missing: Fold2 vs best AF2
Missing: Fold1 vs best AF3
Missing: Fold2 vs best AF3
Missing: Fold1 vs best ESM2
Missing: Fold2 vs best ESM2
Missing: Fold1 vs best ESM3
Missing: Fold2 vs best ESM3
[missing] 3mkoA vs. 5ineA (unaligned) — interactive
[missing] 3mkoA vs. 5ineA (aligned) — interactive

Figure 3: Deep-MSA contact map panel

Figure 4: Best clusters contact map panel

Figure 5: All clusters contact-map mosaic (small multiples).

Per-cluster contact maps

Figure 6: Aligned per-residue ΔΔG (seq alignment overlay).

Figure 7: Phylogenetic tree with per-cluster heatmap.

Cluster metrics table

clusternneffAF2_TM1AF2_TM2AF3_TM1AF3_TM2RE-MSAT-COMRE-MSAT1RE-MSAT2ESM_SEQIDSESM_TM1_LISTESM_TM2_LIST
Deep--0.50.510.490.450.00.00.05---
000--0.480.610.50.450.00.00.04005; 005; 007; 001; 001; 007; 004; 004; 002; 0020.54; 0.54; 0.52; 0.49; 0.49; 0.49; 0.46; 0.46; 0.42; 0.410.16; 0.16; 0.17; 0.24; 0.24; 0.17; 0.30; 0.31; 0.20; 0.21

Aligned per-residue ΔΔG

aln_posaa1aa2E1E2dEdiff
1-N-1.35-
2-G-1.81-
3-P-5.89-
4-D-2.19-
5-I-0.71-
6-Y--3.24-
7-K-0.26-
8-G--0.18-
9-V-8.36-
10-Y--0.26-
11-Q-3.54-
12-F--2.42-
13-K-0.91-
14-S--0.36-
15-V-7.87-
16EE9.69-0.219.91
17-F--6.08-
18-D-0.14-
19-M--1.12-
20-S-1.85-
21-H-0.66-
22-L-14.98-
23-N-467.52-
24-L-9.75-
25-T--2.49-
26-M-8.43-
27-P--3.24-
28-N-4.04-
29-A--0.79-
30-C-2.34-
31-S--0.06-
32-A-2.15-
33-N-448.03-
34-N-3.17-
35-S--0.29-
36-H-0.1-
37-H--2.07-
38-Y--5.74-
39-I--4.71-
40-S--0.97-
41-M--0.29-
42-G--0.17-
43-S-0.83-
44-S-2.4-
45-G--0.77-
46-L-5.18-
47EE-0.11-0.370.27
48-L-11.92-
49-T--2.01-
50FF1.03-1.12.13
51-T-0.14-
52-N-457.61-
53-D-2.96-
54SS10.011.118.89
55-I-8.42-
56-L-0.6-
57-N-5.96-
58-H-3.24-
59-N-4.75-
60-F-7.78-
61-C-22.96-
62-N-470.33-
63-L-6.2-
64-T-6.95-
65-S-0.31-
66-A-0.39-
67-F--3.55-
68-N-1.3-
69-K-8.06-
70-K-23.5-
71-T-1.69-
72-F-1.09-
73DD-1.20.51-1.71
74-H-2.16-
75-T-6.05-
76-L--3.09-
77MM11.740.4511.28
78-S--0.29-
79-I--3.14-
80-V--3.83-
81-S-3.52-
82-S--0.32-
83LL-1.67-1.990.32
84-H-4.11-
85-L--0.33-
86-S--0.45-
87-I-0.45-
88RR-0.39.09-9.39
89-G-0.27-
90-N-5.57-
91-S-3.33-
92-N-0.57-
93-H-4.97-
94-K-2.03-
95-A--2.79-
96-V-2.83-
97-S--0.32-
98-C-0.32-
99-D-3.49-
100-F-0.12-
101-N-4.01-
102-N-11.44-
103-G--1.35-
104-I-6.5-
105-T-6.92-
106-I-4.18-
107-Q--3.21-
108-Y-1.47-
109-N-457.23-
110LL-0.550.87-1.42
111-S-2.32-
112-F-6.22-
113-S-30.12-
114-Q-9.38-
115-C-22.8-
116-R-5.87-
117-T-2.29-
118-F-2.79-
119-R-3.73-
120-G--0.13-
121-R-1.19-
122-V--3.21-
123-L--1.88-
124-D-2.18-
125-M-1.64-
126-F--3.23-
127-R-6.79-
128-T-0.48-
129-A--1.79-
130-F--3.09-
131-G--2.02-
132-G-1.5-
133-K-14.6-
134-Y--0.01-
135-M-1.67-
136-R-5.64-
137-S-1.02-
138-G--0.02-
139-W-7.17-
140-G-1.45-
141-W-12.77-
142-A-18.14-
143-T-8.16-
144-T-6.16-
145-W-4.42-
146-C-2.8-
147-S-0.9-
148-Q-6.01-
149-T-3.96-
150-S-0.88-
151-Y-0.2-
152-Q--2.66-
153-Y--4.56-
154-L--2.76-
155II-0.992.13-3.12
156-I-1.43-
157-Q-4.61-
158-N-464.45-
159-R-1.03-
160-T-6.36-
161-W--0.74-
162-E-3.43-
163-N-3.06-
164-H--1.07-
165-C-5.65-
166-R-5.39-
167-Y-0.35-
168-A--0.46-
169-G--1.8-
170-P--4.53-
171-F--0.71-
172-G-1.41-
173-M--0.38-
174-S--2.14-
175-R--0.57-
176-I--2.09-
177-L-1.05-
178-F--0.82-
179-A-1.56-
180-Q-2.53-
181-E-5.53-
182-K-8.75-
183-T-5.64-
184-K-2.47-
185-F-12.13-
186-L-7.3-
187-T-24.47-
188-T-12.97-
189-F-0.24-
190-T-2.35-
191-W--1.63-
192-T-4.6-
193-L-1.32-
194-S-5.4-
195DD-0.335.88-6.21
196-S-3.77-
197-S-3.35-
198-G-0.25-
199-V-12.41-
200-E-11.05-
201-N-8.23-
202-P-6.37-
203-G-2.55-
204-G-3.08-
205YY0.771.93-1.16
206-C-1.78-
207-L--3.97-
208-T-0.6-
209-K-1.83-
210-W-7.02-
211-M--1.52-
212-I-10.41-
213-L-2.35-
214-A-2.25-
215-A-0.37-
216-E-2.66-
217-L-9.69-
218-K-4.45-
219-C-1.47-
220-F-6.77-
221-G-2.0-
222NN-1.355.48-6.83
223-T-5.33-
224-A--1.21-
225-V-12.41-
226-A-0.66-
227KK-0.964.08-5.04
228-C-2.06-
229-N-1.74-
230-V-7.76-
231-N--0.09-
232-H-2.52-
233-D-4.28-
234-E-2.1-
235-E--1.48-
236-F--4.33-
237-C-2.95-
238-D--3.32-
239-M--1.08-
240-L--4.1-
241-R--4.99-
242-L--5.47-
243-I--1.39-
244-D-3.74-
245-Y--0.72-
246-N--1.03-
247-K-0.42-
248AA-1.39-1.690.3
249AA-1.18-3.472.29
250LL-0.144.5-4.65
251SS-0.49-0.16-0.32
252KK0.131.96-1.83
253FF1.2414.12-12.88
254KK-3.614.5-8.11
255QQ0.637.91-7.28
256DD-3.671.0-4.67
257VV-2.783.46-6.24
258EE4.567.5-2.94
259SS-0.64-0.730.09
260AA-1.39-2.240.85
261LL-2.2-3.711.51
262HH2.452.59-0.14
263VV1.090.140.94
264FF3.04-3.416.45
265KK3.452.70.75
266TT1.040.060.99
267TT0.31-2.02.31
268VV-1.3811.54-12.93
269NN-5.624.17-9.79
270SS0.050.2-0.15
271LL0.78-3.44.19
272II-4.87-4.24-0.64
273SS-0.892.41-3.3
274DD1.375.29-3.92
275QQ10.392.258.15
276LL-3.535.58-9.1
277LL2.73-3.56.23
278MM2.73-0.663.39
279RR-1.343.22-4.56
280NN-1.53-2.160.63
281HH1.672.1-0.44
282LL0.46-0.61.06
283RR5.34-1.376.71
284DD1.071.49-0.42
285LL-2.270.77-3.04
286MM2.22.22-0.02
287GG0.55-2.072.62
288VV-1.091.29-2.39
289PP-4.31-4.80.5
290YY-0.1-2.912.81
291CC0.14-1.091.23
292NN-0.67460.61-461.28
293YY1.98-4.586.56
294SS1.161.96-0.8
295KK0.710.440.27
296FF3.89-6.7510.64
297WW1.74-2.864.6
298YY-4.19-2.79-1.4
299LL-0.03-6.446.41
300EE-0.06-1.931.87
301HH2.89-2.515.4
302AA34.890.4234.47
303-K-6.42-
304-T-4.38-
305-G--1.26-
306-E-11.67-
307-T-0.14-
308-S--2.93-
309-V-0.81-
310PP111.59-4.71116.3
311KK78.212.8775.35
312CC9.54-0.079.61
313WW-1.850.04-1.89
314LL-0.237.04-7.27
315VV-1.03-0.6-0.43
316TT-2.128.86-10.98
317NN1.73468.24-466.52
318GG1.853.48-1.63
319SS-1.34-0.12-1.22
320YY-1.75-0.13-1.63
321LL-2.860.33-3.19
322NN1.53460.99-459.46
323EE2.41.271.13
324TT9.982.927.06
325HH3.254.12-0.86
326FF0.96-0.331.29
327SS-0.771.45-2.22
328DD-0.163.2-3.35
329QQ6.867.61-0.76
330II0.919.52-8.61
331EE1.880.831.05
332QQ-1.544.54-6.08
333EE1.023.37-2.35
334AA-1.21-2.351.14
335DD-3.36-1.39-1.97
336NN-0.851.88-2.74
337MM8.954.594.37
338II0.9313.5-12.57
339TT1.090.190.89
340EE3.944.27-0.33
341MM13.214.448.77
342LL6.754.492.25
343RR20.614.4316.17
344-K-0.68-
345-D-3.17-
346-Y-4.12-
347-I-11.52-
348-K-5.81-
349XX8.19468.39-460.2
350XX-2.69463.26-465.94
351XX-0.38461.97-462.35
352-N-2.21-
353-G-2.57-
354-P--0.9-
355-D-0.98-
356-I-3.1-
357-Y--2.25-
358-K-0.34-
359-G--0.59-
360-V-8.58-
361-Y-0.08-
362-Q-4.03-
363-F--2.34-
364-K-0.88-
365-S--0.3-
366-V-3.47-
367-E--0.27-
368-F--6.02-
369-D-0.12-
370-M--1.19-
371-S-1.87-
372-H-0.61-
373-L-15.03-
374-N-467.27-
375-L-9.58-
376-T--2.52-
377-M-9.07-
378-P--3.46-
379-N-4.04-
380-A--0.8-
381-C-2.37-
382-S-0.03-
383-A-1.93-
384-N-446.06-
385-N-4.38-
386-S--0.33-
387-H-0.08-
388-H--1.97-
389-Y--5.71-
390-I--4.72-
391-S--0.99-
392-M--0.2-
393-G--0.13-
394-S-0.83-
395-S-2.37-
396-G--0.78-
397-L-5.28-
398-E--0.4-
399-L-11.79-
400-T--2.02-
401-F--1.12-
402-T-0.13-
403-N-458.19-
404-D-2.93-
405-S-1.12-
406-I-8.4-
407-L-0.6-
408-N-5.95-
409-H-3.22-
410-N-4.71-
411-F-7.89-
412-C-23.02-
413-N-470.35-
414-L-5.64-
415-T-6.68-
416-S-1.45-
417-A-0.43-
418-F--2.17-
419-N-1.36-
420-K-8.48-
421-K-23.42-
422-T-1.63-
423-F-0.79-
424-D-0.71-
425-H-1.37-
426-T-6.19-
427-L--3.11-
428-M-0.46-
429-S--0.34-
430-I--3.14-
431-V--3.76-
432-S-3.57-
433-S--0.33-
434-L--1.94-
435-H-4.87-
436-L-0.06-
437-S--0.43-
438-I-0.42-
439-R-9.12-
440-G-0.88-
441-N-3.81-
442-S-2.23-
443-N-0.53-
444-H-4.95-
445-K-2.02-
446-A--2.2-
447-V-2.24-
448-S--0.35-
449-C-0.38-
450-D-3.5-
451-F-0.17-
452-N-3.89-
453-N-11.42-
454-G--1.35-
455-I-6.49-
456-T-7.1-
457-I-3.67-
458-Q--3.21-
459-Y-1.53-
460-N-457.26-
461-L-1.11-
462-S-23.71-
463-Q-9.4-
464-C-22.05-
465-R-6.1-
466-T-2.36-
467-F-3.15-
468-R-3.71-
469-G--0.19-
470-R-1.2-
471-V--3.24-
472-L--1.86-
473-D-2.2-
474-M-1.61-
475-F--3.16-
476-R-6.84-
477-T-0.44-
478-A--1.82-
479-F--3.4-
480-G--2.2-
481-G-1.17-
482-K-4.19-
483-Y-0.5-
484-M-1.51-
485-R-6.09-
486-S-1.83-
487-G--0.15-
488-W-6.5-
489-G-1.44-
490-W-12.93-
491-A-3.34-
492-G-29.22-
493-T-9.53-
494-T-6.16-
495-W-3.7-
496-C-3.01-
497-S-0.92-
498-Q-5.8-
499-T-3.95-
500-S-0.99-
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